В работе представлены результаты, полученные в рамках совместного российско-финляндского проекта «Оценка экологического состояния пограничного водоема» на российской части оз. Пюхяярви в 1991–2004 гг. Показано, что оз. Пюхяярви, вследствие его геохимических особенностей, является уникальным для Республики Карелия объектом природы. По уровню содержания общего фосфора озеро приближается к мезотрофному типу. По биологическим показателям – таксономическому составу, показателям численности и биомассы зоопланктона и макробентоса – российская часть озера, не подверженная существенному антропогенному влиянию, в настоящее время относится к типу олиготрофных водоемов.